早期的网站优化资料常常把真的的搜索引擎与目录放在一块讨论，甚至把目录也称为搜索引擎的一种，这种讲法并不准确。真的的搜索引擎由蜘蛛程序沿着链接爬行和抓取网上的很多页面，存进数据，经过处置，用户在搜索框输入查看词后，搜索引擎排序程序从数据库中挑选出符合查看词需要的页面。蛛蛛的爬行、页面的网站收录及排序都是自动处置。网站目录则是一套人工编辑的分类目录，由编辑职员人工创建多个层次的分类，站长可以适合的分类下提交网站，目录编辑在后台审核所提交的网站，将网站放置于相应的分类页面。有些时候编辑也主动网站收录网站，典型的网站目录包含hao123、265.com、开放目录等。目录并非网站优化专员讨论的网站优化所关注的真的的搜索引擎。虽然网站目录也常有一个搜索框，但目录的数据来源是人工编辑得到的。搜索引擎和目录的两者各有优劣，但显然搜索引擎更能满足用户搜索信息的需要。搜索引擎网站收录的页面数远远高于目录收网站收录的页面数。但搜索引擎网站收录的页面水平参差不齐，对网站内容和关键字提取的准确性一般也没目录高。限于人力，目录能网站收录的一般只不过网站首页，而且规模十分有限，不过网站收录的网站一般水平比较高。像雅虎、开放目录、hao123 这类大型目录，网站收录标准特别高。目录网站收录网站时存桂林网站优化外包储的页面标题、说明文字都是人工编辑的比较准确。搜索引擎数据更新快，而目录中网站收录的不少网站内容十分陈旧，甚至有些网站已经不存丰了。雅虎目录、搜狐目录等过去是用户在网上探寻信息的主流方法，给用户的感觉与真的的搜索引擎也差不多。这也就是目录有时被误称为“搜索引擎的一种”是什么原因。少，目前已经极少有人用网站目录探寻信息了。目前的网站目录对网站优化的大意义是建设外链，像雅虎、开放目录、hao123等都有非常高的网站权重，可以给被网站收录的网站带来优质的外链。
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